Ngôi nhà thờ Giáo họ An Đôn đầu tiên đã có từ năm 1668 cùng thời với các thừa sai Paris và linh mục bổn quốc Manuel Bổn xây dựng. Nhà thờ làm bằng vật liệu thô sơ là tranh tre.
Năm 1690 khi cha Lôrensô Lâu (Long) ở phục vụ tại Giáo Hạt Dinh Cát (trụ sở tại Giáo xứ Dương Lệ Văn), năm 1725 cũng chính cha Lôrensô Lâu sau khi từ triều đình Huế trở lại Quảng Trị, ngài chọn trú sở ở Bố Liêu. An Đôn cùng chung linh mục quản xứ này coi sóc.
Năm 1780 nhà thờ An Đôn được xây dựng lại bằng gạch lợp ngói và có linh mục biệt lập coi sóc. Thế nhưng do cơn bắt đạo thời các tướng chúa Trịnh và nhà Nguyễn (Tây Sơn) các linh mục phải ẩn trốn đó đây, và phải nhờ các chức sắc trong vùng như cụ Gioan Baotixita Báu, Đôminicô Trọng che chở và ẩn dấu.
