Chùa Pháp Hoa được xây dựng vào năm 1959 (khi đó chùa có tên là Niệm Phật), sau đó 1 năm trong ngày lễ Vu Lan chùa bị chính quyền Ngô Đình Diệm tàn phá, tàn áp những người đang lễ ở chùa. Đến năm 1969 chùa mới được đổi tên thành chùa Pháp Hoa.
Điện Phật được bài trí trang nghiêm. Các tượng Phật, Bồ tát được tôn trí là: tượng đức Phật Thích Ca, tượng Bồ tát Di Lặc; các tượng Bồ tát Quan Âm, Bồ tát Chuẩn Đề, Bồ tát Địa Tạng, Tiêu Diện, Hộ Pháp … Sân trước chùa có tượng Bồ tát Quan Âm lộ thiên và tháp mộ cố Thượng tọa Thích Trí Huy.
Hiện nay chùa gồm 2 phần chánh điện, tòa tháp 5 tầng, hội trường, tăng xá,…theo kiến thức nhà vườn Huế kết hợp với kiến trúc của nhà sàn ở Tây Nguyên. Cổng chính của chùa nhìn ra đường Hùng Vương, phía trước mặt là thung lũng do đó đứng trên chùa bạn có thể nhìn được toàn cảnh thị xã Gia Nghĩa.
